What to Know
- En FNA-fil er en DNA- og proteinsekvensjusteringsfil i FASTA-format.
- Åpne en med Geneious.
- Konverter til FASTA og lignende formater med det samme programmet.
Denne artikkelen forklarer hva en FNA-fil er, hvordan du åpner en og hvordan du lagrer en i et annet format som FASTA, GB, VCF, bilder osv.
Hva er en FNA-fil?
En fil med filtypen FNA er en FASTA-format DNA- og proteinsekvensjusteringsfil som lagrer DNA-informasjon som kan brukes av molekylærbiologiprogramvare.
FNA-filer kan spesifikt brukes til kun å inneholde nukleinsyreinformasjon mens andre FASTA-formater inneholder annen DNA-relatert informasjon, for eksempel de med FASTA, FAS, FA, FFN, FAA, FRN, MPFA, SEQ, NET eller AA filtypene.
Disse tekstbaserte FASTA-formatene oppsto opprinnelig fra en programvarepakke med samme navn, men brukes nå som en standard i applikasjoner for DNA- og proteinsekvensjustering.
FNA refererer også til noen teknologibegreper som ikke har noe med dette filformatet å gjøre, som endelig nettverksgodkjenning, filnavn/attributtforsterkning, Fujitsu-nettverksarkitektur og rask naboannonsering.
Hvordan åpner du en FNA-fil
Åpne en i Windows, macOS og Linux med Geneious (den er gratis i 14 dager). For å gjøre dette, naviger til File > Import-menyen og velg å importere filen via Fra filmenyelement.
Du kan kanskje også åpne en med BLAST Ring Image Generator (BRIG).
Prøv Notepad++ eller et annet tekstredigeringsprogram hvis disse ideene ikke fungerer. Filen kan faktisk være tekstbasert og enkel å lese, eller du kan finne ut at den ikke har noe med FASTA-formatet å gjøre, i så fall kan det å åpne filen som et tekstdokument avsløre tekst som identifiserer hva som ble brukt til å lage filen eller hvilket format filen er i.
Hvordan konvertere en FNA-fil
Vi kan ikke bekrefte dette siden vi ikke har prøvd det, men du bør kunne bruke Geneious til å konvertere filen til mange andre formater, som FASTA, GB, GENEIOUS, MEG, ACE, CSV, NEX, PHY, SAM, TSV og VCF. Dette kan gjøres gjennom programmets File > Export-meny.
Det samme programmet skal også kunne lagre filen til PNG, JPG, EPS eller PDF, via File > Lagre som bildefil.
Selv om du norm alt ikke bare kan endre navn på en filtype til noe annet og forvente at den skal fungere på samme måte, kan du endre navn på en. FNA-fil til en. FA-fil hvis din spesielle DNA-sekvenseringsprogramvare bare vil gjenkjenne FA-formatet.
I stedet for å gi nytt navn til filtypene, bør du bruke en gratis filkonvertering for å konvertere andre filtyper. Når det gjelder FNA- og FA-filer, kan det hende at noen programmer bare åpner filer som har filendelsen FA, i så fall bør det fungere fint å gi den nytt navn.
Kan du fortsatt ikke åpne den?
Hvis du fortsatt ikke får filen til å åpne etter å ha brukt programmene ovenfra, kan det hende du finner ut at filtypen faktisk ikke leser. FNA, men i stedet noe som bare ligner.
FNG-filer (Font Navigator Group) ser forferdelig mye ut som de sier ". FNA", men hvis du ser nøye etter, er bare de to første bokstavene like. Siden filtypene er forskjellige, er det en indikasjon på at de har et annet filformat og mest sannsynlig ikke vil fungere med de samme programmene.
Det samme kan sies for mange andre filutvidelser som FAX, FAS (Compiled Fast-Load AutoLISP), FAT, FNTA (Aleph One Font), FNC (Vue Functions) og FND (Windows Saved Search).
Ideen her er å bare sørge for at filtypen leser. FNA. Hvis den gjør det, prøv igjen å bruke programmene ovenfra for å åpne eller konvertere den. Hvis du har en annen type fil, kan du undersøke filtypen for å finne ut hvilke programmer som trengs for å åpne eller konvertere den.
FAQ
Hvordan åpner du en FNA-fil i Python?
Konverter først FNA-filen til FASTA-format ved å bruke et tredjepartsprogram som Geneious. Deretter kan du laste ned Biopython, et sett med fritt tilgjengelige verktøy for biologisk beregning for arbeid med bioinformatikk. Til slutt, se Biopython-veiledningen og kokeboken for instruksjoner om hvordan du arbeider med FASTA-filer.
Hvordan finner jeg mine FNA-produsentnumre på en Ancestry-råfil?
Du kan laste ned de fleste DNA-data fra Ancestry.com i.txt-format. Imidlertid er det bare kunder hvis DNA ble analysert med neste generasjons sekvensering (NGS) som har muligheten til å laste ned en VCF-fil. For å laste ned en VCF-fil må du være DNA-eier, ha DNA-testet med NGS-teknologi og ha minst 350 MB ledig plass på enheten din.
